El Centro Científico Tecnológico Mar del Plata se crea dentro del marco de la política Institucional del CONICET, siendo fundamental para desarrollar una desconcentración de la gestión administrativa e institucional.
Su principal objetivo es articular a nivel local las actividades de las Unidades Ejecutoras y los grupos de investigación, asegurando un ámbito apropiado para la ejecución de investigaciones científicas, tecnológicas y de desarrollo en el espacio físico y de influencia que le compete.
Por su parte, la Unidad de Administración Territorial (UAT) de CONICET Mar del Plata tiene como función la administración de fondos para Proyectos de Investigación Plurianuales (PIP) y de Cooperación Internacional.
Funciona también, como mesa de entrada del organismo, ofreciendo asesoramiento y orientación a las distintas instituciones con los que trabaja.
Para ejecutar estas tareas, CONICET Mar del Plata cuenta con los siguientes departamentos: Administración, Patrimonio, Relaciones Institucionales y Comunicación, Informática, Mesa de Entradas, Recursos Humanos, Secretaría de Dirección, Coordinación, y con una Oficina de Vinculación Tecnológica.